Pandora, tout comme la Terre, est constituée d'un noyau liquide, d'un manteau inférieur, d'un manteau supérieur ainsi que d'une croûte rigide. Comme la Terre, elle possède deux sources de chaleur. Premièrement, la désintégration des isotopes radioactifs et, deuxièmement, l'énergie provenant de l'effondrement gravitationnel de sa formation initiale. La force des marrées apporte une énergie supplémentaire et plus grande que sur Terre, les lunes internes et externes les plus proches interagissant avec Polyphème.

La dérive continentale sur Pandora est bien plus rapide que sur Terre en raison de l'excès d'énergie et entraîne une dislocation des plaques tectoniques plus facilement sous l'effet de la contrainte. Cela explique l'absence de vastes continents sur Pandora, ainsi que l'activité volcanique et géothermale.

Bien que, sur Pandora, la proportion de terre par rapport à l'eau soit supérieure à celle de la planète Terre, les blocs sont divisés en un plus grand nombre de petits continents. Ils représentent ainsi un plus grand nombre de côtes et un plus petit nombre de régions intérieures que sur Terre. L'influence modératrice de la proximité des océans réduit les températures extrêmes.

Il existe, tout de même, des glaces polaires comparables à la Terre qui, étant donné l'absence de terre au niveau des pôles, flotte librement.

L'activité volcanique de Pandora est incomparable à celle de la Terre par son importance et sa fréquence. Il y a beaucoup de volcans, à la fois sur les continents et sous les océans. Beaucoup de montagnes ou d'autres surfaces sont d'origines volcaniques récentes. De nombreux geysers et sources chaudes sont dispersés dans le paysage, et certaines rivières sont presque encore en ébullition aux endroits où elles jaillissent de leurs sources souterraines.

Le terrain sur Pandora diffère quelque peu d'un endroit à l'autre. Chaque région a son clan qui lui est propre. Les humains se sont installés dans la région des forêts, qui abrite le clan Omaticaya. Il existe différents écosystèmes dans chaque région, mais la vie sauvage est partout, comme les banshees. Il apparaît également que des masses terrestres flottantes isolées existent dans la région des forêts, mais il y en a d'autres de par le monde. Les différents terrains connus sont la jungle (forêt), les montagnes, les plaines (savane) et les océans. La jungle semble être la plus grande région sur Pandora.